A klímának a rengeteg pozitív tulajdonsága mellett bizony vannak veszélyei is. Vannak akik alapból érzékenyek rá. Van, akinek kiszárad tőle a szája és a torka. Egyesek ízületi gondokra panaszkodnak tőle. Könnyen meg lehet fázni, ha nagy a különbség a kinti és a benti hőmérséklet között.

A legnagyobb veszélye viszont a gombásodás.

A hőcserélőn megtelepedő gombák spórái a szervezetbe jutva ideális tenyész helyet találnak a tüdőben. Komoly légúti, akár halállal végződő problémát is okozhatnak. Ezt megelőzendő évente legalább egyszer, lehetőleg a klímás időszak előtt, ki kell tisztítani speciális tisztítószerrel. Ezt el lehet végezni házilag is, de a klíma javításra szakosodott szervizek nagyobb szakértelemmel és biztosabban tudják elvégezni.